Jan Mlakar je jedna od želja Hajduka u zimskom prijelaznom roku. Kao što je bio i ljetos kad je tadašnji sportski direktor Bijelih Nikola Kalinić pokušavao sve kako bi Slovenca učinio partnerom Marka Livaje u napadu. No, tada ga Pisa nije htjela pustiti na posudbu, no nakon što je u Serie B u ovoj polusezoni odigrao samo 200 minuta u osam utakmica, jasno je da on Pisi nije potreban u borbi za plasman u Serie A. Trener Pippo Inzaghi ga definitivno ne vidi kao igrača, koji u lovu na najviši rang, može pomoći.
Pisa je u kolovozu 2023. godine platila za Mlakara tri milijuna eura odštete, a Slovenac je skupio 24 nastupa, tri gola i dvije asistencije. U Hajduku je, pak, u dvije godine imao 81 nastup, postigao 21 gol i jako dobro se razumio u igri baš s Livajom.